导弹科技工业的军品科研生产体系具有“小核心、大协作”的特点。导弹国防工业参与单位结构，根据其作用和规模主要分为总体单位、二级配套单位和三级配套单位三个层次以及其他通用零部件供应商，呈现出上层研制单位数量少、下层配套单位数量多的金字塔形。由于导弹产业系统性特征，某一型号任务通常由一家总体单位（项目提出单位）总领全系统实施，多家配套单位协作配合。通常来说，一个大型武器系统研制生产的总体单位只有一家，而涉及的配套协作单位却可能多达数百家乃至数千家或上万家。
从事装备科研工作的主体主要包括军种装备研究院、军队和地方高校、军工集团下属的科研院所以及其他的组织或机构。在科研过程中，总体单位负责武器系统的总体设计、综合协调和最后的总装，处于国防工业企业结构金字塔的顶端，构成国防工业的核心。总体单位拥有强大的总体设计、工程研制能力和先进完备的科研基础设施与试验检测手段，主要从事产品的设计、研制和总装生产，也承担部分应用研究和少量基础性研究工作。总体单位直接对国防工业管理部门或军队最终用户负责，掌握项目科研经费或采购费的大部分，依托强大的研制实力，在型号发展、项目分解、资源配置等诸多方面拥有绝对的话语权和支配权，在很大程度上影响或支配我国国内的防务市场。二级配套单位主要负责研制导弹武器系统的分系统和主要部件，如动力装置、制导系统，雷达、计算机和核心电子部件等，如中国电科等。三级配套单位一般是零部件/原材料供应商，负责为总体或二级配套单位提供零部件和原材料，如机电组件、集成电路、惯性导航器件、电源等。
我国军工实行“事业单位科研院所+军工生产企业”的特殊科研生产联合体经营模式，形成了科研院所主要负责技术预先研究、产品研制定型，军工厂主要负责批生产的国防工业产业布局。在总体和二级配套层次上，研究所与军工厂一般都是配对建设的，根据规模生产情况可以分为平行设立和行政隶属两类组织结构；相应地，总体单位包括总体研究院和总装军工厂，二级配套单位包括专业研究所和专业军工厂。三级配套单位在军工系统内也存在类似的经营模式，但是还有大量的零部件/原材料供应商并没用将科研和生产分离，同时负责军用零部件的定制研制和规模生产。
参考观研天下发布《2017-2022年中国军工行业市场发展现状及十三五市场商机分析报告》
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